Станция открыта 15 мая 1935 года в составе первого пускового участка Московского метрополитена — «Сокольники» — «Парк Культуры» с ответвлением «Охотный ряд» — «Смоленская». Названа из-за расположения вблизи знаменитых Чистых Прудов.

Имеется наземный вестибюль, расположенный в начале Чистопрудного бульвара. Через него можно выйти, помимо бульвара, на площадь Мясницкие ворота и Мясницкую улицу. Из центрального зала можно попасть в переход на станцию «Тургеневская» Калужско-Рижской линии. Также можно сделать пересадку на станцию "Сретенский Бульвар" Люблинской линии (переход открылся 13 января 2008 года).

Пассажиропоток составляет: по входу — 29,2 тысяч человек, по выходу — 31,2 тысяч человек.

"Чистые Пруды" — пилонная трёхсводчатая станция глубокого заложения (глубина — 35 метров). Сооружена по индивидуальному проекту горным способом с обделкой из монолитного бетона.

Своды станционного зала поддерживают два ряда массивных спаренных пилонов, облицованых светлым уральским мрамором «коелга» и дымчатым мрамором «уфалей». Опоры свода скрыты широкими карнизами, за которыми размещены светильники. Пол выложен серым и розовым гранитом (до 1972 года покрытие было асфальтовым). У торцевой стены находится бронзовый бюст С. М. Кирова (так как до 5 ноября 1990 станция называлась «Кировская»).